Niektóre schorzenia oraz inne okoliczności mogą być przeciwwskazaniem do stosowania lub wskazaniem do zmiany dawkowania preparatu. W niektórych przypadkach konieczne może być również przeprowadzenie określonych badań kontrolnych. U niektórych pacjentów, zwłaszcza u osób chorych na poważne schorzenia, takie jak AIDS lub nowotwory, stosowanie flukonazolu może wiązać się z ryzykiem uszkodzenia wątroby, nerek oraz zmian w parametrach hematologicznych i biochemicznych. Bardzo rzadko obserwuje się ciężkie uszkodzenia wątroby, jednak mogą one być spowodowane również przez inne leki toksyczne dla wątroby oraz przebieg choroby. Prawdopodobnie wielkość dawki, czas trwania leczenia, wiek i płeć pacjenta nie mają wpływu na ryzyko toksycznego działania na wątrobę. U osób z zaburzeniami czynności wątroby, przed rozpoczęciem terapii oraz w trakcie leczenia zaleca się regularne badania parametrów wątrobowych. Jeżeli pojawią się objawy niewydolności wątroby, lekarz zaleci zaprzestanie przyjmowania preparatu. W przypadku objawów sugerujących zaburzenia wątroby, takich jak zmęczenie, ciemne zabarwienie moczu, żółtaczka, nudności, wymioty, brak apetytu, konieczna jest natychmiastowa konsultacja lekarska. W przypadku reakcji alergicznych na leki lub inne substancje skonsultuj się z lekarzem przed zastosowaniem preparatu. Stosowanie flukonazolu może być związane z wystąpieniem ciężkich reakcji alergicznych typu anafilaktycznego lub poważnych zmian skórnych. Chorzy na AIDS są bardziej narażeni na reakcje skórne. W przypadku pojawienia się wysypki u pacjentów leczonych z powodu grzybic skórnych, należy przerwać terapię i skonsultować się z lekarzem. W przypadku wysypki u pacjentów z grzybicą układową skonsultuj się z lekarzem, który zaproponuje dalsze postępowanie i kontrolę stanu zdrowia. W przypadku zmian skórnych konieczne może być przerwanie terapii. Stosowanie flukonazolu może wiązać się z wydłużeniem odcinka QT oraz ryzykiem zaburzeń rytmu serca, zwłaszcza u pacjentów z czynnikami ryzyka. Leki wpływające na wydłużenie odcinka QT, choroby serca, zaburzenia rytmu serca, niski poziom potasu, magnezu lub wapnia mogą zwiększać ryzyko. Stosowanie flukonazolu u pacjentów z czynnikami ryzyka rytmu serca wymaga zachowania ostrożności. Preparat może wchodzić w interakcje z innymi lekami, co może prowadzić do działań niepożądanych. Preparat zawiera laktozę, dlatego osoby z nietolerancją galaktozy, niedoborem laktazy lub problemami z wchłanianiem glukozy–galaktozy nie powinny go stosować. Flukonazol nie wpływa istotnie na zdolność prowadzenia pojazdów i obsługiwania maszyn.

Preparat dostępny jest w postaci tabletek do stosowania doustnego. Należy przestrzegać zaleceń lekarza dotyczących dawkowania preparatu. Nie należy przekraczać zalecanych dawek, ponieważ może to zaszkodzić zdrowiu. W przypadku wątpliwości należy skonsultować się z lekarzem. Dawkowanie preparatu może być dostosowane w szczególnych grupach pacjentów. Dla dorosłych i dzieci powyżej 13. roku życia: dawki preparatu zależą od rodzaju zakażenia grzybicznego. W przypadku kandydozy pochwy zazwyczaj stosuje się jednorazowo 150 mg. Dawkowanie w innych rodzajach grzybic jest różne i dostosowywane indywidualnie przez lekarza. Preparat nie jest wskazany u dzieci poniżej 6. miesiąca życia ani u pacjentów z obniżoną odpornością. W przypadku osób starszych nie ma konieczności dostosowania dawkowania, natomiast u pacjentów z zaburzeniami czynności nerek zalecane jest dostosowanie dawki przez lekarza. Ostateczne dawkowanie powinno być ustalone indywidualnie dla każdego pacjenta.

Informuj lekarza o wszystkich stosowanych lekach, zarówno na receptę, jak i bez recepty. Należy unikać jednoczesnego stosowania flukonazolu z astemizolem, cisaprydem, pimozydem, terfenadyną oraz erytromycyną. Ryfampicyna może zmniejszać ekspozycję na flukonazol, dlatego konieczne może być zwiększenie dawki flukonazolu. Leki moczopędne z grupy tiazydów mogą zwiększać stężenie flukonazolu we krwi. Flukonazol może wpływać na stężenie innych leków metabolizowanych przez cytochrom P450. Należy zachować ostrożność przy jednoczesnym stosowaniu flukonazolu z lekami takimi jak doustne leki przeciwzakrzepowe, benzodiazepiny, leki przeciwcukrzycowe, fenytoina czy cyklosporyna. Flukonazol nie ma wpływu na skuteczność antykoncepcji. W razie potrzeby należy kontrolować stężenie leków we krwi podczas równoległego stosowania z flukonazolem. Flukonazol można przyjmować doustnie z jedzeniem, cymetydyną i lekami zobojętniającymi sok żołądkowy bez wpływu na wchłanianie.